Центральной категорией философской системы Шао Юна, объединяющей все ее уровни, является «Великий предел». Разработка проблематики «Великого предела» в творчестве Шао Юна обусловила внимание к ней на всем протяжении истории неоконфуцианства.
По Шао Юну, единый, неподвижный «Великий предел» лежит в основе космогенеза. Процесс космогенеза, и являющееся его проекцией мироздание, состоит из двух сфер — сферы «прежденебесного» и «посленебесного». Эти два этапа космогенеза Шао Юн отождествил соответственно с двумя последовательностями расположения триграмм — «прежденебесным» и «посленебесным». Сфера «посленебесного», совпадающая со сферой «послеформенного», возникает с установлением «телесности». Различие этих сфер также определяет состояние cил инь–ян: на «прежденебесном» этапе они находятся в нерасторжимой гармонии, на «посленебесном» — разделяются. Грань между сферами, переход от «бестелесного» к «телесному» Шао Юн называет «беспредельным», «не-пределом» или «пределом наличия/бытия и отсутствия/небытия».
«Великий предел» является одной из сторон дао, как и «Великое сокрытое» и «Великое единое». Дао — «корень Неба и Земли», которые, сами принадлежали к области «оформленного», в свою очередь являются «корнем» для всех вещей. Дао наделяет вещи «предопределением», проявляющимся в них как структурообразующий «принцип» и «индивидуальная природа». Берущий начало в тай цзи — источнике метаморфоз вселенной — «дух», являющийся их движущей силой, объединяет человека и все сущее. Основное отличие человека от «десяти тысяч вещей» — в том, что он способен постигать их дао.
Развивая заложенные в комментариях-«крыльях» «И цзина» представления о происхождении из «Великого предела» «двух образцов», «четырех образов» и восьми триграмм, Шао Юн описал основанную на геометрической прогрессии систему возникновения 64 гексаграмм из «Великого предела». С точки зрения Шао Юна, существование всех объектов «посленебесного», в т.ч. человека, подчиняется числовым закономерностям, проявляющимся в символических построениях. Эти представления легли в основу теоретической системы Шао Юна.
Шао Юн создал свою концепцию бесконечно повторяющихся космических циклов. Этапы развития циклов выражаются сменой гексаграмм. Так, начало цикла связывается с гексаграммой фу, обозначающей возникновение активности силы ян, его расцвет — с гексаграммой цянь, пиком активности ян, а конец — с гексаграммой кунь, воплощением силы инь. Каждый цикл, длящийся 129 600 лет, состоит из 12 эпох, эпоха — из 30 «оборотов», равных 12 поколениям по 30 лет. Пропорции этих этапов Шао Юн соотносит с календарем — год, как и главный цикл, состоит из 12 месяцев по 30 дней в каждом, день делится на 12 страж, каждая по 30 больших минут. В первую эпоху возникает Небо, во вторую появляется Земля, в третью — человек; на период наивысшего расцвета силы ян приходится шестая эпоха, рассматривающаяся как своего рода «золотой век». Но уже с седьмой эпохи начинается рост силы инь, продолжающийся вплоть до конца цикла.